RECAINSA nace en el 2013, bajo el nombre de Red Centroamericana de Informática en Salud, como una red de voluntarios y profesionales de los sectores de la salud y de las TIC aplicadas, con la intención de apoyar las estrategias nacionales en salud digital. A partir del 2019, inicia la transición de RECAINSA para convertirse en una organización sin fines de lucro, lo cual se concluye en 2021 con la constitución legal de Red Centroamericana de Informática en Salud ONG, RECAINSA ONG, en Guatemala, pero con operación en toda la región de América Latina y El Caribe de habla hispana.
Dado el posicionamiento de la organización en América Latina, con proyectos de ejecución en más de 10 paises, en el 2023 se decide utilizar únicamente el nombre RECAINSA, dejando así el nombre de Red Centroamericana, registrando la organización legalmente en Argentina y en los Estados Unidos de América.